江州直属库腐败窝案被一锅端后，叶行舟按照常铁山的要求，组织二室对案件进行了全面复盘。
复盘会上，叶行舟说：“解剖一只麻雀，目的是搞清麻雀的内脏结构。
江州直属库的问题不是孤例，全市、全省的粮库都可能存在类似情况。
我们在查办案件的同时，要把问题归类，把制度漏洞找出来，把查办经验总结出来，供其他地方参考。”
经过梳理，二室形成《江州直属库违纪违法案件剖析报告》。
不久，省纪委召开全省粮食购销领域腐败问题专项整治经验交流会。
江州市纪委在会上作经验交流。
接下来，二室工作重点，一是指导县区纪委，查办其他粮库问题，二是重点查办交通系统案件。
叶行舟把交通系统案件材料要了过来，并把吴吉良叫到自己办公室。
叶行舟在较短时间内就成功查办直属库贪腐窝案，吴吉良对他越来越佩服，从一开始心有怨气、心里不服气，到心悦诚服。
吴吉良在介绍交通系统案件情况后说：“叶主任，到目前为止，我们只留置了市交通局一位科长。
这位科长目前的涉案金额只查实二十几万元，但科长一直在对抗审查。”
叶行舟问：“是骨头硬，还是指望有人捞他？”
吴吉良说：“两方面都有。叶主任，不瞒你说，案件之所以迟迟没有重大突破，在我看来，主要存在两大问题。
第一，我怀疑纪检系统有内鬼，对手不仅知道举报信内容，还了解案件进展。
他们根据我们线索情况和查办进展，采取针对性的措施。
比如，订立攻守同盟。我们每查到一个线索，刚准备找人谈话，对方就已经做好了准备。
要么证人改口，要么材料对不上，要么关键人物联系不上。
好像我们每一步动作，对方都提前知道。
第二，案件背后可能有大鱼。举报信上点名的是市交通局副局长孙海涛，但我觉得，孙海涛未必是最大的鱼。”
叶行舟问：“你有什么依据？”
吴吉良说：“举报信提到几个工程，一个是绕城高速北段，一个是江州东互通，还有一个是西江大桥。
这几个工程，投资动辄几亿、十几个亿。
孙海涛作为分管副局长，确实能在招投标、工程分包上做手脚。
但这么大的盘子，光靠一个副局长根